Un moulin est indiqué dans ce secteur sur la carte de l'embouchure de la Garonne de 1759. La carte de Belleyme représente "le Moulin de la Marque".
L'édifice en partie conservé porte la date de 1822. Sur le plan cadastral de 1826, le lieu dit "Aux deux moulins" est bien occupé par deux moulins, accompagnés d'un bâtiment devant abriter la maison du meunier.
Les augmentations et diminutions des matrices cadastrales indiquent que le moulin à vent, situé au nord, appartenant à M. Pigneguy (parcelle 174), est démoli en 1855 et que la maison (parcelle 171) est en ruine à partir de 1860.
Les éditions de l'ouvrage de Cocks et Féret (1886, 1893, 1898 et 1908) mentionnent un cru bourgeois "Les Deux Moulins" produisant 25 tonneaux et dont le propriétaire est M. Pamponneau.